1962年由昆蟲研究所和動物研究所合并成為現(xiàn)在的動物研究所。動物研究所目前擁有三個國家重點實驗室，即計劃生育生殖生物學(xué)國家重點實驗室、農(nóng)業(yè)蟲鼠害綜合治理研究國家重點實驗室、與清華大學(xué)和北京大學(xué)聯(lián)合的生物膜與膜生物工程國家重點實驗室;建立了動物生態(tài)與保護生物學(xué)院重點實驗室和動物進化與系統(tǒng)學(xué)院級重點實驗室;有樣本量達580萬余的動物標本館;還建立了國家動物博物館，以及眾多的野外觀察研究臺站和基地。

　　研究所主要定位在圍繞農(nóng)業(yè)、生態(tài)、環(huán)境和人類健康及其人與自然協(xié)調(diào)并存等方面的重大需求和科學(xué)問題，在珍稀瀕危動物保護、有害動物控制、資源動物可持續(xù)利用、動物疾病預(yù)警與防控、生殖與發(fā)育生物學(xué)、動物系統(tǒng)學(xué)和進化生物學(xué)等領(lǐng)域開展基礎(chǔ)性、前瞻性、戰(zhàn)略性研究。動物研究所在2003年全國一級學(xué)科生物學(xué)學(xué)科評估中整體水平排名第二，2009年全國一級學(xué)科生物學(xué)學(xué)科評估中整體水平排名第五，在2005年及2010年獲得全國優(yōu)秀博士后流動站榮譽稱號。1981年，國務(wù)院學(xué)位委員會批準動物研究所為我國首批具有博士、碩士學(xué)位授予權(quán)單位;1987年獲準開展具有研究生畢業(yè)同等學(xué)力的在職人員理學(xué)碩士學(xué)位、博士學(xué)位資格授予工作;1988年經(jīng)全國博士后管委會批準建立博士后科研流動站;1994年獲準為博士生導(dǎo)師自行評定單位;1997年、2000年先后兩次被評為中國科學(xué)院博士生重點培養(yǎng)基地;1998年被國務(wù)院學(xué)位委員會批準為一級學(xué)科(生物學(xué))博士、碩士學(xué)位授予權(quán)單位;2008年，動物研究所“生態(tài)學(xué)”獲得北京市重點學(xué)科建設(shè)資助;2011年，生態(tài)學(xué)、動物學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、細胞生物學(xué)四個學(xué)科被中科院評為重點學(xué)科。

　　2010年，增設(shè)生物工程碩士培養(yǎng)點;2011年，又成功增列生物醫(yī)學(xué)工程、免疫學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)三個學(xué)術(shù)型碩士培養(yǎng)點�，F(xiàn)有在學(xué)研究生600多人。

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