東南大學(xué)的學(xué)科屬于比較全的，現(xiàn)在一共有九個學(xué)科門類，16個一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點，我們有二級學(xué)科點96個，碩士點210個，博士后流動站20個。 
　　學(xué)校的學(xué)科特色很顯著，而且多學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展，為研究生教育提供了堅實的基礎(chǔ)�，F(xiàn)在有交通運輸工程等一級國家重點學(xué)科，以及結(jié)構(gòu)工程、藝術(shù)學(xué)、計算機應(yīng)用技術(shù)和控制理論與控制工程等二級學(xué)科國家重點學(xué)科，同時學(xué)校的機械制造及其自動化專業(yè)是國家重點培育的學(xué)科，學(xué)校現(xiàn)在擁有三個國家重點實驗室，兩個國家工程研究中心，七個教育部重點實驗室，四個教育部重點重點工程研究中心。在教育部2007到2009年全國學(xué)科評估高校排名中，學(xué)校有五個學(xué)科進入全國前五名，其中生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科列全國第一位，交通運輸工程位列第二位，建筑學(xué)和藝術(shù)學(xué)均位列第三位土木工程位列第五位，另有電子科學(xué)與技術(shù)、儀器科學(xué)與技術(shù)、信息與通信工程、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、電氣工程、動力工程及工程熱物理等六個學(xué)科進入全國前十名，高水平學(xué)科數(shù)量位居全國同類高校前列。